根據兩化融合管理體系標準要求，貫標主要分為體系建立、體系實施、體系認定及體系保持和改進四個階段，其典型工作流程如下圖：
1、體系建立階段
體系建立階段主要進行兩化融合評估、企業戰略-可持續競爭優勢-新型能力脈絡梳理、兩化融合方針和目標的確定、兩化融合實施框架策劃以及體系文件編寫及發布。
主要成果：《兩化融合體系評估報告》、《兩化融合現狀評估報告》、《兩化融合制度編制清單》、兩化融合體系文件。
2、體系實施階段
體系實施階段主要進行體系試運行、內容審核、問題整改和管理評審。
主要成果：方針、目標、新型能力的確定、兩化融合實施框架、《兩化融合策劃方案》、《兩化融合管理體系內審報告》、《兩化融合體系管理評估報告》。
3、體系認定階段
體系認定階段主要進行符合性評審、迎審準備（申請書、兩化融合建設情況匯報材料、體系建設過程整體證明材料）、現場審核、審核中發現問題整改。
主要成果：依據兩化融合管理體系標準進行信息化項目實施的過程系列文件。
4、體系保持和改進階段
體系保持和改進階段主要進行體系復合型、有效性評審、體系改進點及過程記錄、年度體系復核等。
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