第一、ISO22000標準適用范圍更廣： ISO22000標準與HACCP相比，突出了體系管理理念，將組織、資源、過程和程序融合到體系之中，使體系結構與ISO9001標準結構完全一致，強調標準既可單獨使用，也可以和ISO9001質量管理體系標準整合使用，充分考慮了兩者兼容性。ISO22000標準適用范圍為食品鏈中所有類型的組織，比原有的HACCP體系范圍要廣。
第二、ISO22000標準強調了溝通的作用溝通是食品安全管理體系的重要原則： 顧客要求、食品監督管理機構要求、法律法規要求、以及一些新的危害產生的信息，須通過外部溝通獲得，以獲得充分的食品安全相關信息。通過內部溝通可以獲得體系是否需要更新和改進的信息。
第三、ISO22000標準體現了對遵守食品法律法規的要求：ISO22000標準不僅在引言中指出“本標準要求組織通過食品安全管理體系以滿足與食品安全相關的法律法規要求”，而且標準的多個條款都要求與食品法律法規相結合，充分體現了遵守法律法規是建立食品安全管理體系前提之一。
第四、ISO22000標準提出了前提方案、操作性前提方案和HACCP計劃的重要性：“前提方案”是整個食品供應鏈中為保持衛生環境所必需的基本條件和活動，它等同于食品企業良好操作規范。操作性前提方案是為減少食品安全危害在產品或產品加工環境中引入、污染或擴散的可能性，通過危害分析確定的基本前提方案。HACCP也是通過危害分析確定的，只不過它是運用關鍵控制點通過關鍵限值來控制危害的控制措施。兩者區別在于控制方式、方法或控制的側重點不同，但目的都是為防止、消除食品安全危害或將食品安全危害降低到可接受水平的行動或活動。
第五、ISO22000標準強調了“確認”和“驗證”的重要性： “確認”是獲取證據以證實由HACCP計劃和操作性前提方案安排的控制措施有效。ISO22000標準在多處明示和隱含了“確認”要求或理念。“驗證”是通過提供客觀證據對規定要求已得到滿足的認定。目的是證實體系和控制措施的有效性。ISO22000標準要求對前提方案、操作性前提方案、HACCP計劃及控制措施組合、潛在不安全產品處置、應急準備和響應、撤回等都要進行驗證。
第六、ISO22000標準增加了“應急準備和響應”規定：ISO22000標準要求最高管理者應關注有關影響食品安全的潛在緊急情況和事故，要求組織應識別潛在事故(件)和緊急情況，組織應策劃應急準備和響應措施，并保證實施這些措施所需要的資源和程序。
第七、ISO22000標準建立可追溯性系統和對不安全產品實施撤回機制： ISO22000標準提出了對不安全產品采取撤回要求，充分體現了現代食品安全的管理理念。要求組織建立從原料供方到直接分銷商的可追溯性系統，確保交付后的不安全終產品，利用可追溯性系統，能夠及時、完全地撤回，盡可能降低和消除不安全產品對消費者的傷害。
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