首先，兩套標準都是ISO組織制訂的針對管理方面的標準，都是國際貿(mào)易中消除貿(mào)易壁壘的有效手段。
其次，兩套標準的要素有相同或相似之處。（見下表）
再次，兩套標準最大的區(qū)別在于面向的對象不同，ISO9000標準是對顧客承諾，ISO14001標準是對政府、社會和眾多相關(guān)方（包括股東、貸款方、保險等等）ISO9000標準缺乏有效的外部監(jiān)督機制，而實施ISO14001準的同時，就要接受政府、執(zhí)法當局、社會公眾和各相關(guān)方的監(jiān)督。
最后，在體系中，兩套標準部分內(nèi)容和體系的思路上有著本質(zhì)的不同，包括環(huán)境識別、重要環(huán)境評價與控制，適用環(huán)境法律、法規(guī)的識別、獲取、遵循狀況評價和跟蹤最新法規(guī)，環(huán)境目標指標方案的制定的實施完成，以期達到預防污染、節(jié)能降耗、提高資源能源利用率，最終達到環(huán)境行為的持續(xù)改進的目的。
環(huán)境方針 質(zhì)量方針
組織結(jié)構(gòu)和職責 職責與權(quán)限
人員環(huán)境培訓 人員質(zhì)量培訓
環(huán)境信息交流 質(zhì)量信息交流
環(huán)境文件控制 質(zhì)量文件控制
應急準備和響應 (部分與消防安全的要求相同)
不符合、糾正和預防措施 不符合、糾正和預防措施
環(huán)境記錄 質(zhì)量記錄
內(nèi)部審核 內(nèi)部審核
管理評審 管理評審
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