高新技術企業認定專項審計報告，是高新技術企業認定的一項重要評審依據，用于評審確定申報企業近三個會計年度研究開發費用、近一個會計年度高新技術產品(服務)收入等重要指標數據，關乎高新技術企業認定工作客觀性、公正性和真實性。高新技術企業認定專項審計(以下簡稱“高新專項審計”)工作政策性強、審計風險大，要求注冊會計師應具有良好的職業道德，勤勉盡責，了解國家科技、經濟及產業政策，熟悉《高新技術企業認定管理辦法》和《高新技術企業認定管理工作指引》等相關政策，熟練掌握并有效執行《高新技術企業認定專項審計指引》。為幫助我省會計師事務所進一步提升高新專項審計質量，有效控制執業風險，浙江省注冊會計師協會專業技術委員會提示注冊會計師在執行高新專項審計時，應重點關注以下幾方面的審計風險，供大家在執業 中參考。
本提示僅代表專家觀點，不能替代相關法律、法規、執業準則，也不能替代注冊會計師的職業判斷，在執業中注冊會計師應結合項目實際情況合理使用。
一、關注業務承接的風險
因高新技術企業享受企業所得稅優惠，且地方政府對申報高新技術企業實行相關獎勵政策等因素，企業申報高新技術企業積極性普遍較高。目前，部分企業存在委托科技中介機構代理申報高新技術企業，并由科技中介機構負責編制申報企業全部資料的情形。一些科技中介機構為了業績，不如實編制申報高新技術企業資料。為切實防范審計風險，會計師事務所應當特別關注科技中介機構代理申報高新技術企業的審計項目，著重把握好以下環節：
(一)了解申報企業擁有的高新技術與企業主要產品(服務)之間的關系，判斷申報企業是否獲得對其主要產品(服務)在技術發揮核心支持作用的知識產權的所有權。如果申報企業未獲得對其主要產品(服務)在技術發揮核心支持作用的知識產權的所有權，會計師事務所不應承接該申報企業高新專項審計業務。
(二)實地勘察企業的研發場所，了解企業的技術特點和研發流程，了解企業創新技術的來源，了解企業研發支出的構成，了解研發人員狀況、研發用固定資產等情況，關注研發支出、研發人員、研發固定資產等與研發項目的相關性。在實地勘察企業過程中，如果發現申報企業不符合高新技術企業認定的基本條件，會計師事務所不應承接該申報企業高新專項審計業務。
(三)了解并審閱申報企業近三個會計年度(實際經營期不滿三年的按實際經營時間計算)賬載的研究開發費用情況，比較年度企業所得稅申報表中期間費用明細表所填報研發費用數據，以及申報企業近三個會計年度開展研究開發活動而發生的研究開發費用總額，判斷其是否達到高新技術企業認定條件。如果申報企業近三個會計年度按適用企業會計準則或企業會計制度歸集核算的研究開發費用(未審數)未達到認定條件，會計師事務所不應承接該申報企業高新專項審計業務。
(四)會計師事務所承椄高新專項審計業務，應當與委托申報企業簽訂高新專項審計業務約定書，不得與科技中介機構簽訂高新專項審計業務約定書。
二、關注委托外部研發費用的審計風險
在高新技術企業認定申報過程中，申報企業為使研究開發費用總額達到高新技術企業認定條件，存在虛構、虛增委托外部研究開發費用的可能性。審計過程中，發現申報企業委托外部研究開發費用占比較高時，注冊會計師應對申報企業支付的委托外部研發費用的真實性和合理性予以重點關注。注冊會計師至少應當實施下列審計程序：
(一)分析委托外部研究開發合同實施情況，抽查會計憑證，檢查相應的合同和發票等憑據。
(二)獲取并逐個審核申報企業近三個會計年度賬面列支的委托外部研究開發費用支出對應的委托外部研發所有技術合同，判斷申報企業這些委托外部單位或個人開展的研究開發活動及其支付的委托外部研究開發費用是否符合《高新技術企業認定管理工作指引》規定，包括委托研究開發活動成果是否為申報企業擁有，且與該申報企業的主要經營業務緊密相關。
(三)通過詢問、觀察等程序關注委托外部單位或個人技術研發事項內容與研發項目的關聯性和合理性，了解并查核申報企業委托外部研發獲取的技術研發成果與對應申報獲取的知識產權的相關性，關注申報企業是否將大部分的研發內容外包、技術合同是否經認定機構認定登記，查詢被委托單位的工商登記信息，關注被委托單位或個人是否具備相應的研發資質和能力，必要時應到被委托單位實施訪談等程序。
三、關注研發費用占比處于認定指標臨界狀態時的審計風險
申報企業研發費用占銷售收入比例等關鍵指標處于臨界狀態時，注冊會計師應重點予以關注。例如：企業近三個會計年度的研究開發費用總額占同期銷售收入總額的比例剛好達到高新技術企業的認定標準。
對指標處于臨界狀態的申報企業，注冊會計師應審慎把握：
(一)重點關注申報企業臨近年末研發領用的大宗材料，核驗領用的材料是否用于研發項目；檢查臨近年末的大額委托外單位的研究開發費用支出，檢查合同和委托外單位研究開發的具體內容，判定委托外單位研究開發支出是否與本單位的研發項目相關，必要時可聘請技術專家予以幫助。
(二)檢查企業銷售收入入賬的完整性，了解銷售合同簽訂、產品出庫、發運和驗收情況，或服務合同的執行情況，了解企業銷售收入確認政策是否符合《企業會計準則》等規定，確定企業的收入是否完整。
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