一. 原理
離子交換色譜的固定相是交換劑，根據(jù)交換劑性質(zhì)可分為：
陽離子交換劑和陰離子交換劑。
交換劑由固定的離子基團(tuán)和可交換的平衡離子組成。當(dāng)流動(dòng)相帶著組分離子通過離子交換柱時(shí)，組分離子與交換劑上可交換的平衡離子進(jìn)行可逆交換，最后達(dá)到交換平衡，陰陽離子的交換平衡可表示為：
陽離子交換： R+Y- + X- = R+X-+ Y-
陰離子交換： R-Y+ + X+ = R-X++ Y+
R+ 、R-—為交換劑上的固定離子基團(tuán)，如RSO3-或RNH3+；
Y+、Y-—為可交換的平衡離子，可以是H+、Na+或OH-、Cl-等
X+ 、X-—為組分離子。
組分離子對(duì)固定離子基團(tuán)的親和力強(qiáng)，分配系數(shù)大，其保留時(shí)間長；反之，分配系數(shù)小，其保留時(shí)間短；因此：
離子交換色譜：是根據(jù)不同組分離子對(duì)固定離子基團(tuán)的親和力的差別而達(dá)到分離的目的。
二. 固定相
離子交換色譜固定相：早期離子交換色譜法采用離子交換樹脂作為固定相，有溶脹和收縮現(xiàn)象，不耐高壓，而且表面微孔結(jié)構(gòu)影響傳質(zhì)，柱效低，現(xiàn)已被離子交換鍵合相所取代。
離子交換鍵合相：是以薄殼型或全多孔微粒硅膠為載體，表面經(jīng)化學(xué)反應(yīng)鍵合上各種離子交換基團(tuán)。若帶上磺酸基（－SO3H 強(qiáng)酸性）、羧基（一COOH 弱酸性）就是陽離交換樹脂；若帶上季胺基（-NR3Cl強(qiáng)堿性）或胺基（-NH2弱堿性）就是陰離子交換劑。
（分離分析：核苷酸、碳水化合物、有機(jī)酸、蛋白質(zhì)、酶等）
三. 流動(dòng)相
離子交換色譜流動(dòng)相：通常是鹽類的緩沖溶液。通過改變流動(dòng)相的 pH、緩沖劑（平衡離子）的類型、離子強(qiáng)度以及加入有機(jī)溶劑、配位劑等都會(huì)改變交換劑的選擇性，影響樣品的分離效果。
常用的緩沖劑有：磷酸鹽、乙酸鹽、檸檬酸鹽、甲酸鹽、氨水等。
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