企業從政府部門取得的研發專項撥款，可以作為不征稅收入處理，也可以根據企業自身需要作為征稅收入處理。哪種處理方式對企業來說最劃算呢？
近日，某高新技術企業從政府部門取得500萬元研發專項撥款，全部用于新產品設計費支出，在“管理費用——研發費用”科目單獨核算歸集。根據《財政部、國家稅務總局關于專項用途財政性資金企業所得稅處理問題的通知》（財稅〔2011〕70號）規定，企業從縣級以上各級人民政府財政部門及其他部門取得的應計入收入總額的財政性資金，凡同時符合以下條件的，可以作為不征稅收入，在計算應納稅所得額時從收入總額中減除：企業能夠提供規定資金專項用途的資金撥付文件；財政部門或其他撥付資金的政府部門對該資金有專門的資金管理辦法或具體管理要求；企業對該資金以及以該資金發生的支出單獨進行核算。因此，該企業取得的這筆研發專項撥款可作為不征稅收入處理。
當其按不征稅收入處理時，這筆專項撥款用于支出將涉及如下稅務處理。根據《企業所得稅法實施條例》第二十八條規定，企業的不征稅收入用于支出所形成的費用或者財產，不得扣除或者計算對應的折舊、攤銷扣除。根據《財政部、國家稅務總局關于財政性資金、行政事業性收費、政府性基金有關企業所得稅政策問題的通知》（財稅〔2008〕151號）第三條的規定，企業的不征稅收入用于支出所形成的費用，不得在計算應納稅所得額時扣除；企業的不征稅收入用于支出所形成的資產，其計算的折舊、攤銷不得在計算應納稅所得額時扣除。根據財稅〔2011〕70號文件第二條和實施條例第二十八條的規定，上述不征稅收入用于支出所形成的費用，不得在計算應納稅所得額時扣除；用于支出所形成的資產，其計算的折舊、攤銷不得在計算應納稅所得額時扣除。
根據上述規定，不征稅收入用于支出所形成的費用不得在稅前扣除，形成的資產不得計算折舊、攤銷在稅前扣除。
那么，如果企業將研發專項撥款作為應稅收入，則其專項撥款用于支出時也應允許在所得稅前扣除。即企業應確認收入額為500萬元，允許稅前扣除額為750萬元[500×（1＋50%）]。
二者對比，當企業將專項撥款用于應稅收入時，可以減少企業應納稅所得額250萬元。因此，將這筆研發專項撥款作為應稅收入對企業來說更劃算。

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