核算難點
《高新技術企業認定管理辦法》規定，高新技術企業認定必須滿足最近三個會計年度研究開發費用總額占銷售收入總額的一定比例。因此，申報企業為了達到標準可能虛列研究開發費用，擴大研究開發費用總額。
應對措施
（1）獲取經具有高新技術企業認定資質的會計師事務所審計的，最近三個會計年度的審計報告和財務報表。
（2）復算加計最近三個會計年度的銷售收入總額。《高新技術企業認定申請書》填報說明表明，銷售收入是指產品收入和技術服務收入之和；復算加計最近三個會計年度的研究開發費用總額。
（3）復算研究開發費用總額占銷售收入總額的比例，與申報企業計算的結果核對是否一致；復算在中國境內發生的研究開發費用總額占全部研究開發費用總額的比例，與申報企業計算的結果核對是否一致。
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