知識產權海關保護備案，是指知識產權權利人為了尋求海關對其知識產權實施依職權保護，按照《中華人民共和國知識產權海關保護條例》的規定，將其擁有知識產權情況向海關總署申請備案的制度。知識產權海關保護備案自海關總署核準備案之日生效，有效期為10年（知識產權權利剩余有效期不足10年的，按照實際剩余有效期限計算）。
1、知識產權海關備案是海關采取主動保護措施（依職權保護）的前提條件。根據《中華人民共和國知識產權海關保護條例》的規定，知識產權權利人如果事先將其知識產權向海關備案，海關對其發現的侵權貨物有權主動中止其進出口，并對侵權貨物進行調查處理。反之，如果沒有事先備案，海關就無法對涉嫌侵權的貨物進行調查處理。
2、知識產權海關備案可以減輕知識產權權利人的經濟負擔。根據《中華人民共和國海關關于〈中華人民共和國知識產權海關保護條例〉的實施辦法》相關規定，在海關依職權保護模式下，知識產權權利人向海關提供的擔保最高不超過人民幣10萬元，同時還可進一步向海關總署申請辦理知識產權海關保護總擔保。如事先未進行知識產權海關備案，則知識產權權利人不能享受上述待遇，必須提供與其要求扣留的貨物等值的擔保。
3、知識產權海關備案有助于讓海關發現侵權貨物。知識產權權利人在申請備案時，需提供有關知識產權的法律狀況、權利人的聯系方式以及合法使用知識產權等情況，使海關有可能在日常監管中發現侵權嫌疑貨物并主動予以扣留。
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