高新技術企業確實是國家重點支持項目，不管是稅收還是資金獎勵。我從畢業就接觸了這個行業，從業多年后發現盡管高企優勢很多，但是還是很多人拒絕，主要有以下幾個原因:
1.企業財務怕麻煩:一些企業有自己記賬的財務人員，尤其是還有一定話語權的財務人員，會勸說老板不要做。因為高企通過后，會涉及到多個網址的年報、季報、研發費用輔助賬、研發費用加計扣除等工作，工資沒增加，工作量增加了。他們一般會把稅收等問題往嚴重了說，企業老板最怕啥，就是稅務局了，所有有一部分企業會選擇放棄申請。
2.地方問題:1）當地沒有獎勵，現在小微的稅收力度又很高，所以沒必要申請。2)還有就是確實存在當通過后，地方政府經常上門的問題。
3.費用問題:申請高企不單單是需要支付第三方(很多企業項目申報人員)機構的費用，還有知識產權費用、審計費用等。
4.高新申報材料問題（不過多陳述了）。
5.老板：1)有一些企業，看不上一些稅收優惠、資金獎勵。一心一意搞項目。2)現在第三方機構較多，很多老板一天接到10幾個電話，心中已經厭煩，導致放棄申請。
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