高新技術企業需要準備的材料很多，涉及到企業研發、財務、行政和人事部門的相關工作，但是各個材料存在關聯性和統一性，而有些材料需要多個部門協調配合共同完成。
比如：自主知識產權相關資料主要是企業工程部配合專利代理機構提供，企業財務部門要做好相關的專利費用統計，提供授權專利最近一期的年費繳費收據。企業財務部門涉及到的高企材料準備工作和注意事項：
一、財務相關材料
申報高新技術企業的企業財務部門需提供的主要財務資料如下：
年財務審計報告或報表;
年財務審計報告及財務情況說明;
年研發費用專項審計報告
年高新技術產品收入專項審計報告
年企業所得稅年度納稅申報表及差異說明
二、高新技術產品相關工作
企業財務部門需提供年高新技術產品銷售發票、出口報關單、購銷合同。(備注：每個產品提供2份以上對應材料)。
三、自主知識產權涉及材料
自主知識產權的準備工作主要由企業工程部配合專利代理機構提供相關材料，財務部門務必做好授權專利最近一期的年費繳費收據。
四、申報系統操作注意事項
企業財務部門的工作人員需要配合代理機構的項目工程師，按時登錄“國家高新技術企業認定管理工作網”完成系統注冊、填報、提交材料等的一系列工作內容。
系統提交完電子材料后，科技局進行預審，看初稿;大概一周左右出預審結果。通過后，財務部門人員需要提交高企申報紙質材料至各地方。
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