1.ISO14000與ISO9000具有共同的實施對象：在各類組織建立科學、規范和程序化的管理系統。
2.兩套標準的管理體系相似：ISO14000某些標準的框架、結構和內容參考了ISO9000中某些標準規定的框架、結構和內容。
ISO14000與ISO9000在內涵和承諾對象上不同，主要表現在：
1.承諾對象不同：ISO9000標準的承諾對象是產品的使用者、消費者，它是按不同消費者的需要，以合同形式進行體現的。而ISO14000系列標準則是向相關方的承諾，受益者將是全社會，是人類的生存環境和人類自身的共同需要，這無法通過合同體現，只能通過利益相關方，其中主要是政府來代表社會的需要，用法律、法規來體現，所以ISO14000的最低要求是達到政府的環境法律、法規與其它要求。
2.承諾的內容不同：ISO9000系列標準是保證產品的質量；而ISO14000系列標準則要求組織承諾遵守環境法律、法規及其它要求，并對污染預防和持續改進作出承諾。
3.體系的構成模式不同：ISO9000的質量管理模式是封閉的，而環境管理體系則是螺旋上升的開環模式。要求體系不斷地有所改進和提高。
4.審核認證的依據不同：ISO9000標準是質量管理體系認證的根本依據；而環境管理體系認證除符合ISO14001外，還必須結合本國的環境法律、法規及相關標準，如果組織的環境行為不能滿足國家要求，則難以通過體系的認證。
5.對審核人員資格的要求不同：ISO14000系列標準涉及的是環境問題，面對的是如何按照本國的環境、法規、標準等要求保護生態環境，污染防治和處理的具體環境問題，故環境管理體系對組織有目標、指標的要求，因而從事ISO14000認證工作的人員必須具備相應的環境知識和環境管理經驗，否則難以對現場存在的環境問題做出正確判斷。
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